네..전혀 A와B라는 다른 주제의 블로그를 운영해도 상관없어요.. 예를 들어 A 블로그에 사용할 애드센스 광고 코드를 생성하고 나서 그 광고코드를 생성할 때 채널을 만들어서(이건 애드센스 코드 만드는 과정에 나오니 어렵지 않아요) "A블로그 1"라는 채널을 만들구요...
다시 B블로그에 달 애드센스 코드를 만들어서 "B블로그 1"이라는 채널을 할당해주면 두 블로그의 광고가 노출수랑클릭수, 클릭률 등을 알 수 있어요.(아니면 쉽게 코드 하나만 생성해서 두 블로그에 같이 운영해도 되구요(이럴 경우 각 블로그당 노출수나 클릭수, 클릭률 등은 합산이 되니 개별적인 자료를 알 수 없겠죠)
물론 블로그마다 다른 사이즈의 광고코드를 만들 수가 있어서 채널을 생성하면 그 광고코드별로 수익이나 노출 등을 파악하기 쉽습니다.